Chromosome 9


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Chromosome 9


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Band 9q13

chr9:61500000-65000000 (3500 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 9q13
  • Genes in band 9q13 (reference hg38)
  • External links
  • References

    Chromosomal abnormalities in band 9q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
    9q119q13Mitelmandel(9)(q11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST118993]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST130562]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST141992]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma[PubMed] 
    9q139q13dbCRIDdel(9)(q13.1q13.4)  10760Mesenchymal Hamartoma of Liver[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST222498]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST450810]pancreas__NScarcinoma__NS[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST500207]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Anaplastic large cell lymphoma, systemic type  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q13 Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST154189]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma[PubMed] 
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184000]skin__NScarcinoma__NS[PubMed] 
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184916]skin__NScarcinoma__NS[PubMed] 
    9q139q22Cosmic_SVdel(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST159068]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma[PubMed] 
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute promyelocytic leukemia (FAB type M3)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Bilineage or biphenotypic leukemia  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Mycosis fungoides/Szary syndrome  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    9q139q22Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
    9q139q31dbCRIDdel(9)(q13q31)  11160Myelodysplastic Syndrome[PubMed] 
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q139q31Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q139q32Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    9q139q33Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q139q33Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9q139q34Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9q139q34Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9q1312q24Mitelmander(12)t(9;12)(q13;q24)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q1317p11Mitelmander(17)t(9;17)(q13;p11)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    1p369q13Mitelmander(1)t(1;9)(p36;q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    5q119q13Mitelmander(5)t(5;9)(q11;q13)  Mitelman (CGAP) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
    1q129q13Mitelmander(9)t(1;9)(q12;q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9q13 Cosmic_SVdup(9)(q13)  Cosmic_SV [COST442852]pancreas__NScarcinoma__NS[PubMed] 
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST126375]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST129503]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q139q22Cosmic_SVdup(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST134583]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma[PubMed] 
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13)  10012Psoriasis[PubMed] 
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13)  10653Isolated Growth Hormone Deficiency[PubMed] 
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic myelomonocytic leukemia  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP)LungSquamous cell carcinoma  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9p119q13Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Nonneoplastic hematologic disorder/lesion  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Bilineage or biphenotypic leukemia  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
    9p129q13Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST116673]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST119217]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9p139q13dbCRIDinv(9)(p13q13)  10673Hypohidrotic Ectodermal Dysplasia[PubMed] 
    1p369q13Mitelmant(1;9)(p36;q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
    1q129q13Mitelmant(1;9)(q12;q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    5q119q13Mitelmant(5;9)(q11;q13)  Mitelman (CGAP) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
    8p119q13dbCRIDt(8;9)(p11.2;q13)  11732[PubMed] 
    8q249q13Mitelmant(8;9)(q24;q13)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    9q1312q24Mitelmant(9;12)(q13;q24)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
    9q1317p11Mitelmant(9;17)(q13;p11)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    10q239q13Cosmic_SVu(10;9)(q23;q13)  Cosmic_SV [COST749482]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    16q249q13Cosmic_SVu(16;9)(q24;q13)  Cosmic_SV [COST153238]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma[PubMed] 
    18q129q13Cosmic_SVu(18;9)(q12;q13)  Cosmic_SV [COST133273]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    1q219q13Cosmic_SVu(1;9)(q21;q13)  Cosmic_SV [COST446270]liver__NScarcinoma__NS[PubMed] 
    2p169q13Cosmic_SVu(2;9)(p16;q13)  Cosmic_SV [COST573826]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    2p169q13Cosmic_SVu(2;9)(p16;q13)  Cosmic_SV [COST725408]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    2q229q13Cosmic_SVu(2;9)(q22;q13)  Cosmic_SV [COST759875]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    2q229q13Cosmic_SVu(2;9)(q22;q13)  Cosmic_SV [COST771570]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    3p139q13Cosmic_SVu(3;9)(p13;q13)  Cosmic_SV [COST739207]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    7q349q13Cosmic_SVu(7;9)(q34;q13)  Cosmic_SV [COST358574]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q1310q23Cosmic_SVu(9;10)(q13;q23)  Cosmic_SV [COST730918]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    9q1312q23Cosmic_SVu(9;12)(q13;q23)  Cosmic_SV [COST170489]adrenal_gland__adrenal_glandadrenal_cortical_carcinoma__cortisol_and_virilizing_syndrome-producing  
    9q1314q11Cosmic_SVu(9;14)(q13;q11)  Cosmic_SV [COST127949]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
    9q1315q25Cosmic_SVu(9;15)(q13;q25)  Cosmic_SV [COST379320]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
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    9q132p25Cosmic_SVu(9;2)(q13;p25)  Cosmic_SV [COST559970]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
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    9p219q13Cosmic_SVu(9)(p21;q13)  Cosmic_SV [COST373927]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma[PubMed] 
      Cosmic_SVu(9;)(q13;)  Cosmic_SV [COST517961]lung__NScarcinoma__adenocarcinoma  
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    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST577122]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
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    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST727083]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST729983]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
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    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST767010]pancreas__NScarcinoma__NS[PubMed] 
    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST770859]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma[PubMed] 
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    9q139q21Cosmic_SVu(9)(q13;q21)  Cosmic_SV [COST341328]breast__NScarcinoma__NS[PubMed] 
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    9q139q22Cosmic_SVu(9)(q13;q22)  Cosmic_SV [COST238882]bone__NSosteosarcoma__NS  

    Genes in band 9q13

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr9:61861564-61862615 - 9q13   Gene [G]     LOC105379807       [Omim] [Entrez]
    chr9:61867082-61869138 - 9q13   Gene [G]     LOC102723709       [Omim] [Entrez]
    chr9:62452490-62522018 + 9q13   Gene [G]     LINC01189       [Omim] [Entrez]
    chr9:62532562-62542812 + 9q13   Gene [G]     LOC103908604       [Omim] [Entrez]
    chr9:62801465-62813486 + 9q13   Gene [G]     LINC01410       [Omim] [Entrez]
    chr9:62834248-62838346 - 9q13   Gene [G]     LOC100132249       [Omim] [Entrez]
    chr9:62840645-62847206 + 9q13   Gene [G]     PTGER4P2-CDK2AP2P2       [Omim] [Entrez]
    chr9:62897376-62899777 + 9q13   Gene [G]     LOC728673       [Omim] [Entrez]
    chr9:63017995-63028857 + 9q13   Gene [G]     LOC101928381       [Omim] [Entrez]
    chr9:63064491-63125869 - 9q13   Gene [G]     LOC101928195       [Omim] [Entrez]
    chr9:63112403-63127100 - 9q13   Gene [G]     LOC286297       [Omim] [Entrez]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q12 Gene [CT]   AQP7P1/RBFOX2 AQP7P1 RBFOX2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q13 Gene [CT]   AQP7P1/TSPO AQP7P1 TSPO [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13   Gene [G]     AQP7P1       [Omim] [Entrez]
    chr9:63812941-63819029 + 9q13   Gene [G]     LINC00537       [Omim] [Entrez]
    chr9:63832050-63859634 - 9q13   Gene [G]     FRG1JP       [Omim] [Entrez]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13 8q24 Gene [CT]   NDUFB9/FLJ43315 FLJ43315 NDUFB9 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13   Gene [G]     FLJ43315       [Omim] [Entrez]
    chr9:64369394-64469242 + 9q13   Gene [G]     ANKRD20A4-ANKRD20A20P       [Omim] [Entrez]
    chr9:64369563-64412691 + 9q13   Gene [G]     ANKRD20A4       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 [previous]   9 9p 9q 9p24 9p23 9p22 9p21 9p13 9p12 9p11 9q11 9q12 9q13 9q21 9q22 9q31 9q32 9q33 9q34   [next]

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    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 9q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 9q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

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  • Gene list (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)
  • References

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    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjanv. 2019Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 9q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : https://atlasgeneticsoncology.usal.es/classic/Bands/9q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mar. janv. 22 11:49:17 CET 2019

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